哈密市历史悠久。距今1万年的七角井细石器文化遗址，是新疆目前发现最早的人类活动遗迹。研究哈萨克历史的学者苏北海等人认为：公元前2世纪，乌孙人以哈密为王都，游牧于哈密，乌孙人王号“昆莫”（库木勒）成为哈密绿洲的名称。这个说法被多数学者认可，汉文帝四年（前176年），哈密为匈奴呼衍王南部领地。汉神爵二年（前60年），匈奴日逐王降汉，汉在西域置都护府，哈密隶属西域都护府。汉永平十六年（73年），汉置“宜禾都尉”，屯田伊吾。这是哈密屯田之始。此后，汉王朝与匈奴人多次发生争战，西域时得时失，史称“三通三绝”。魏黄初三年（222年），在哈密置宜禾伊吾都尉。晋永宁元年（301年），西域长史、戊己校尉隶凉州刺史，哈密亦归其管辖。前凉建兴五年至升平二十年（317～376年），在哈密置伊吾都尉。在此后的前秦、后凉、西凉等中原政权更替中，哈密分别属于这些政权管辖。北魏天兴五年（402年），哈密被柔然役属，20年后西凉被灭，唐契、唐和与西凉王裔李宝奔赴哈密，招集流亡2 000余户，柔然封唐契为伊吾王。这是哈密历史上第一个地方封王。北魏太和十二年（489年），哈密城主高羔子内附，北魏置伊州郡。隋大业四年（608年），隋将薛世雄进军伊吾，另筑新城戍卫，置伊吾郡和柔远镇。唐贞观四年（630年）置西伊州，两年后改称伊州，辖伊吾、柔远、纳职三县。嗣后，一度为吐蕃占领，后被沙州人张义潮收复。唐开成五年（840年），漠北回鹘汗国被灭，其部众一支西迁高昌，建立高昌回鹘汗国，哈密隶属高昌。宋初伊州州将为汉人陈氏。元称哈密力，隶属甘肃行省。明洪武二十五年（1392年），太祖许蒙裔兀纳失里复国为王；永乐二年（1404年），诏封其弟安克帖木儿为忠顺王。这是哈密历史上第二个地方封王。两年后设立哈密卫，西域各国贡使、商旅去内地必经哈密，将其公文译成汉文，办理入关手续。清康熙三十五年（1696年），哈密维吾尔头领额贝都拉首先摆脱准噶尔统治，协助清王朝平定准噶尔叛乱，次年被封为一等札萨克，赐印编旗。这是哈密历史上第三个地方封王，统治时间长达233年。清乾隆二十四年（1759年），清政府设立哈密厅。清同治十三年（1874年），左宗棠征剿阿古柏侵略军，哈密是其重要的军事重镇。光绪六年（1880年），左宗棠将大营迁到哈密，哈密遂成为新疆当时的政治、军事中心。1884年新疆建省，哈密为直隶厅。民国2年（1913年），哈密改厅为县。1949年9月25日、26日，新疆国民党军政当局宣布和平起义，10月1日中华人民共和国成立，哈密历史进入新的纪元。1954年4月，国务院决定哈密县城关区成立县辖哈密市，1956年撤销，设置哈密镇建制。1961年1月25日，国务院决定以哈密镇为基础成立县级哈密市，次年10月20日撤销。1977年1月6日，国务院决定以哈密镇、城郊公社为主恢复哈密市建制，同年4月14日，宣布哈密市正式成立。
1983年9月，国务院决定撤销哈密县建制，政区并入哈密市，次年5月，撤县并市工作完成。2011年底，哈密市辖18个乡镇（91个行政村场）、5个街道办事处（36个居委会）、1个现代农业园区管理委员会，总人口45.79万人。 出自《哈密市年鉴》(2012） 文字来源哈密市史志办。
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