克孜勒苏柯尔克孜自治州位于新疆维吾尔自治区西南部,地跨天山山脉西南部、帕米尔高原东部、昆仑山北坡和塔里木盆地西北缘。自治州北部和西部分别与吉尔吉斯斯坦和塔吉克斯坦两国接壤,边境线长达1
“克孜勒苏”,柯尔克孜语意为“红水”。境内有克孜勒苏河穿境而过,故在自治州成立时,决定以克孜勒苏作为自治州的名字。
2010年,自治州辖阿图什市和阿克陶、乌恰、阿合奇3县。下辖2个街道办事处、37个乡镇(含一个塔吉克民族乡)。自治州首府是阿图什市。全州总户数135 169户,总人口539 849人,其中柯尔克孜族147 955人、维吾尔族345 112人、汉族39 680人、塔吉克族5 526人、回、乌孜别克、哈萨克等其他民族1 576人。人口密度为7.45∕平方千米。
克孜勒苏自治州自古以来就是祖国不可分割的神圣领土。根据境内性质未定的原始文化遗迹和出土的人头骨化石推断,大约早在一万七千年以前,境内即有原始人类活动。到了大约距今6 000年左右的中石器时代,境内的先民已经能够打磨细石器,用于狩猎和从事简单的农耕生产。大约在3 000年前,我国中原社会已经进入奴隶社会的鼎盛时期,境内仍然处于母系社会的部落联盟状态。同时境内平原地区出现定居农耕文化,山区为狩猎和放牧的游牧文化。据我国史籍所载,中原的黄帝、舜帝、尧帝等都与境内的部落联盟有过密切的交往。《竹书纪年》载“黄帝时西王母献白环,舜帝时又献之”;“尧,西王母献其白王官”;“舜受终西王母献益地图”;《贾谊新书》称:“黄帝涉流沙,登于昆仑,于是还归中国”;尧帝“身涉流沙,地封独山,西见王母,驯及大夏、渠叟”。从这些记载中可以明确看出,境内的西王母之邦等部落联盟与中华古帝从长期的友好往来,最后到人心所向、众望所归、回归中国。
到了秦汉之际,境内的以母系社会为基础的部落联盟逐步解体,以各个绿洲自为体系的从事定居农业的“城廓诸国”以及以从事游牧的“行国”逐步形成。境内的阿图什属疏勒国,阿克陶属桢中国,乌恰属捐毒国,阿合奇属尉头国。汉神爵二年(前60),统治西域的匈奴日逐王先贤掸率部归汉,汉朝政府设西域都护府以统之,从此克孜勒苏即正式划入汉朝版图。三国时期,州境隶属魏国。西晋时隶于西域长史府,东晋十六国时先后隶于前梁、前秦、后凉、西凉等政权。南北朝时隶于北朝,受辖于西戎校尉府。隋朝统一全国后,隶于隋朝,受西突厥王庭的统治。唐平息西突厥之乱后,在境内设蔚头州、疏勒都督府等地方建置,直接隶属于中央王朝陇右道所辖的安西都护府。宋、辽时期分属喀喇汗王朝和高昌政权,后为喀喇汗王朝所统一。13世纪又为西辽所统治。元统一后为察合台后王封地。明代始辖于别失八里的喀什噶尔,后又为叶尔羌汗国所统辖。清初为准噶尔汗国所统治。清政府重新统一并建立新疆省后,分别隶属于阿克苏道和喀什噶尔道。民国时期分属新疆省喀什行政区和阿克苏行政区。
中华人民共和国成立之初,境内仍分属新疆省的喀什专区和阿克苏专区。1954年克孜勒苏柯尔克孜自治州成立,仍隶于新疆省,1955年10月隶属于新疆维吾尔自治区。